有害氣體凈化塔屬兩相逆向流填料吸收塔。廢氣體從有害氣體凈化塔體下方進氣口沿切向進入凈化塔，在通風機的動力作用下，迅速充滿進氣段空間，然后均勻地通過均流段上升到填料吸收段。在填料的表面上，氣相中酸性（或堿性）物質與液相中堿性（或酸性）物質發生化學反應，反應生成物質隨吸收液流入下部貯液槽。未完全吸收的酸性（或堿性）氣體繼續上升進入噴淋段。在噴淋段中吸收液從均布的噴嘴高速噴出，形成無數細小霧滴，與氣體充分混合接觸，繼續發生化學反應，然后酸性（堿性）氣體上升到二級填料段、噴淋段進行類似的吸收過程。
    噴嘴密度不同，噴液壓力不同，吸收酸性（堿性）氣體濃度范圍也有所不同。在噴淋段及填料段兩相接觸的過程也是傳熱與傳質的過程。通過控制空塔流速與滯留時間保證這一過程的充分與穩定。有害氣體凈化塔體的上部是除霧段，氣體中所夾的吸收液霧滴在這里被清除下來，經過處理后的潔凈空氣從有害氣體凈化塔上端排氣管排入大氣。